Real Time-PCR (RT-Polymerase Chain Reaction), Αλυσιδωτή Αντίδραση Πολυμεράσης Πραγματικού Χρόνου

PCR or the Polymerase Chain Reaction has become the cornerstone of modern molecular biology the world over.

Real-time PCR is an advanced form of the Polymerase Chain Reaction that maximizes the potential of the technique. 

Η Αλυσιδωτή Αντίδραση της Πολυμεράσης (PCR) έχει γίνει ακρογωνιαίος λίθος της σύγχρονης μοριακής βιολογίας σε όλο τον κόσμο.

Αλυσιδωτή Αντίδραση Πολυμεράσης σε Πραγματικό χρόνο μεγιστοποιεί της δυνατότητες της συγκεκριμένης τεχνικής.

PCR is a technique for amplifying DNA. There are 2

reasons why you may want to amplify DNA. Firstly you may

want to simply create multiple copies of a rare piece of

DNA. For example a forensic scientist may want to amplify

a tiny piece of DNA from a crime scene. More commonly

however you may wish to compare 2 different samples

of DNA to see which is the more abundant. DNA analysis

requires amplification in order for there to be enough DNA

 to give a detectable signal for quantification. 

H τεχνική PCR δημιουργεί μεγάλο αριθμό αντίγραφων ενός μορίου DNA. Υπάρχουν διάφοροι λόγοι που μπορεί να κάνουν χρήσιμο τον μεγάλο αριθμό αντιγραφων μορίου DNA: α) Ένα δείγμα DNA που λήφθηκε απο τον τόπο ενός εγκλήματος μπορεί να περιέχει αρχικά λίγα αντίγραφα DNA, που δύσκολα ταυτοποιούνται. β) Επίσης μπορεί να είναι χρήσιμο αν θέλει να συγκρίνει κανείς δυο διαφορετικά δείγματα DNA.

 Polymerase chain reaction (PCR) can detect harmful bacteria and other microbes with certainty. These highly reliable results help food companies develope and produce safe food.

This analytical technology is becoming more and more easy to peform and economicaly feasable as both prices of instruments and reagents are decresing every year.
The speed and accuracy of DNA-based detection is imperative. User friendly software makes results interpretatioan in less than a secont.

H PCR μπορεί να χρησιμοποιηθεί για ανίχνευση παθογόνων βακτηρίων ή άλλων μικροοργανισμών με μεγάλη ακρίβεια και ευαισθησία. Τα υψηλής αξιοπιστίας αποτελέσματα που δίνει αυτή η τεχνική είναι δυνατό να βοηθήσουν σημαντικά την ασφάλεια των  τροφίμων. Τόσο ο απαιτούμενος εξοπλισμός όσο και τα απαραίτητα αντιδραστήρια γίνονται όλο και πιο φθηνά κάθε χρόνο. H ταχύτητα και η ακρίβεια της ανίχνευσης του DNA με την PCR είναι εκπληκτικές. Φιλικό προς το χρήστ λογισμικό μπορεί να ερμηνευσει τα αποτελέσματα σε λιγότερο απο 1 δευτερόλεπτο.    

  PCR can be used quantitatively (Quantitative real-time PCR), semi-quantitatively, i.e. above/below a certain amount of DNA molecules (Semi quantitative real-time PCR).

Η PCR μπορεί να χρησιμοποιηθεί σαν ποσοτική (Quantitative real-time PCR) η ημι-ποσοτική μέθοδος(Semi quantitative real-time PCR).

more information περισσότερες πληροφορίες:

 http://www.primerdesign.co.uk/assets/files/beginners_guide_to_real_time_pcr.pdf

 http://www.dupont.com/products-and-services/food-protection/dupont-food-diagnostics/brands/bax.html

 https://en.wikipedia.org/wiki/Real-time_polymerase_chain_reaction

 

Τι είναι "η Μικροβιολογία πρόβλεψης" ; - What is "Predictive microbiology"

Η προστασία των τροφίμων απο τους μικροορρανισμούς είναι ένα απο τα σπουδαιότερα ζητήματα για τη βιομηχανία τροφίμων. H γνώση των παραγόντων που επηρεάζουν την ανάπτυξη παθογόνων μικροοργανισμών στα τρόφιμα είναι ιδιαίτερα σημαντική. Η ανάπτυξη των μικροοργανισμών εξαρτάται απο μεταβλητές όπως η θερμοκρασία, το pH, το αλάτι, η παρουσία αερίων στη συσκευασία, το νιτρώδες νάτριο. Αυτές επιδρούν σημαντικά στην επιβίωση, την ανάπτυξη ή την μείωση μικροβίων που ενδεχομένως να βρεθούν σε ένα τρόφιμο.

• Η "κλασική μικροβιολογία τροφίμων" απαιτεί σειρά μικροβιολογικών αναλύσεων κατά τον χρόνο αποθήκευσης-ζωής του τροφίμου. Με αυτές τις επίπονες, εκτεταμένες και χρονοβόρες μικροβιολογικές αναλύσεις γίνεται γνωστό πώς συμπεριφέρονται οι μικροοργανισμοί που βρίσκονται ) ή μπορεί να βρεθούν στο τρόφιμο που παράγει (ή σχεδιάζει) μια βιομηχανία.
• Στην "μικροβιολογία πρόβλεψης" ακολουθείτε διαφορετική πρακτική। Έχουν κατασκευαστεί προγράμματα-μοντέλα ηλεκτρονικού υπολόγιστή στα οποία μπορεί κανείς "περιγράψει" (pH, θερμοκρασιά κλπ) το τρόφιμο και το μικροοργανισμό που τον ενδιαφέρει. Ακολούθως το πρόγραμμα μπορεί να προβλέψει αν ο μικροοργανισμός θα πολλαπλασιαστεί, σε πόσες μέρες θα αλλοιώσει το τρόφιμο, με ποιο ρυθμό θα πολλαπλασιαστει κ.ο.κ.. Στην πραγματικότητα τα μοντέλα που χρησιμοποιούνται στη μικροβιολογία πρόβλεψης έχουν καταχωρημένα στοιχεία εκατοντάδων αντίστοιχων μετρήσεων που έγιναν σε αντίστοιχα τρόφιμα. Ουσιαστικά ο υπολογιστής απαντάει σε δευτερόρεπτα σε ένα ερώτημα για την ασφάλεια του τροφίμου που κανονικά θα απαιτούσε αναλύσεις εβδομάδων, μηνών η (σε ορισμένες περιπτώσεις) ετών. Φυσικά θα απαιτηθούν και εργαστηριακές αναλύσεις του τροφίμου (για επιβεβαίωση της πρόβλεψης του υπολογιστή). Όμως αυτές οι αναλύσεις θα είναι σαφώς λιγότερες, καλύτερα "στοχευμένες" και πολύ περισσότερο αξιόπιστες. Ουσιαστικά θα επιβεβαιώνουν την πρόβλεψη ενός προγράμματος που έχει συσωρευμένη γνώση, εμπειρία και πειραματικά δεδομένα εκατοντάδων ερευνητικών ομάδων.


• Ενδεικτικά πληροφορίες μπορεί να βρεί κανείς στο http://www.combase.cc/

Protection of food from microbial contamination is a major concern for food industry. A key issue in controlling foodborne pathogens is understanding
the factors influencing their growth. The growth of microorganisms in foods is affected by a
large number of variables (depending on the microorganism and environment). Examples include
temperature, pH, sodium nitrite (NaNO2), sodium chloride (NaCl), and presence of gaseous
atmosphere. Understanding the effect of various conditions on the growth of microorganisms is
essential in evaluating their survival potential and identifying factors important in controlling
their existence and minimizing potential risks.
Predictive microbiology provides objective means for evaluating the effect of processing
operations on microbial growth, and shelf life and safety of food products. Predictive
microbiology is a possible alternative (or complementary) to traditional or rapid microbiological methods. Actually predictive microbiology involves the use of PC programs that can predict microbial growth, provided the accurate knowledge of products profile (pH, temperature etc). These programs (models) are based on expiraments done by hudrends of scientists in various parts of the world. Afterwards computer predictions are comfirmed by traditional microbiology" measurments.

A very good link is http://www.combase.cc/

Ασφάλεια Τροφίμων: Η άποψη του Έλληνα καταναλωτή / Food safety - Greek Consumers Views

Ορισμένα ενδιαφέροντα στοιχεία παρουσιάστηκαν σχετικά με την άποψη του Έλληνα καταναλωτή για την ασφάλεια των τροφίμων:

• Οι περισσότεροι θεωρούν ασφαλέστερα τα ντόπια προϊόντα.
• Εμπιστεύονται περισσότερο τα συσκευασμένα προϊόντα μεγάλων εταιριών.
• Θεωρούν λιγότερο ασφαλή τα εισαγόμενα και χύμα προϊόντα.

Στην ίδια έρευνα οι καταναλωτές θεώρησαν πως προστατεύονται κυρίως από:

• την οικογένεια τους,
• τους επιστήμονες και
• τις καταναλωτικές οργανώσεις.

Η έρευνα έγινε απο την MRB για το Ίδρυμα Αριστείδης Δασκαλόπουλος. http://www.iad.gr/assets/media/PDF/T/422.pdf
Ενδιαφέρον αναλυτικό άρθρο υπάρχει και στο Αθηναϊκό Πρακτορείο Ειδήσεων http://www.ana.gr/anaweb/user/showplain?maindoc=7401790&maindocimg=4988063&service=95

Interesting views on food safety of average Greek consumer came up in a servey run by MRB for Aristidis Daskalopoulos Institute.

Most Greek consumers trust:

• localy produced food.
• packaged food produced by big companies.

On the other hand, they trust less the safety of bulk (not packed) imported food.

The same consumers feel better protected:

• by their family
• scientists
• consumer organisations

links:
http://www.iad.gr/assets/media/PDF/T/422.pdf
http://www.ana.gr/anaweb/user/showplain?maindoc=7401790&maindocimg=4988063&service=95